Żeby usunąć subdomenę, po zalogowaniu się do panelu DirectAdmin, w sekcji "Twoje konto", należy kliknąć w "Zarządzanie Subdomenami". Otworzy się okno widoczne poniżej. Aby usunąć subdomenę zaznacz subdomenę, którą chcesz usunąć i naciśnij "Delete Selected". Następnie pojawi się pytanie o chęć usunięcia katalogu z danymi. Jeśli chcesz usunąć także dane, które zawierała ta subdomena zaznacz pole z katalogiem i plikami do usunięcia. W przeciwnym razie subdomena przestanie działać, a pliki pozostaną na dysku.